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国家基因库的现状,如何实现结果转化

意大利贵宾会  宣布时间:2015-01-09 16:37:24 作者:SystemMaster
       2014年12月30日,国家基因库一期工程封顶仪式在深圳举行,这标记着我国生物工业的战略性生长向前迈进了要害的一步。

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国家级基因库

       近年来,美国、欧盟、日本等兴旺国家已将;せ蜃试戳腥氡竟铰约苹,划分建立了国家级的基因数据库(NCBI、EMBL和DDBJ)和条理差别的生物样本资源库。而我国生命科学和生物工业虽生长迅速,但大宗的生物样本和基因数据的收集,生存、分类治理以及应用尚不规范,因此,需要建立技术领先、标准规范、共享效劳、宁静可靠的国家级基因库。

       深圳国家基因库是我国推动生物工业生长和基因技术研究的重大科技基础设施,着眼于为本国生命科学研究和生物工业生长提供基础性和公益性效劳平台,贮存和治理我国特有的遗传资源、生物信息和基因数据,是具有国家水平、效劳国家战略需求的公益性立异科研和工业基础项目。作为中国第一个国家级基因库,截止目前已累计处理了近300万份生物样本。

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       生物谷联系到了深圳华大基因研究院、国家基因库的研究员张勇博士。张勇研究院像我们介绍道,国家基因库接纳资源样本库,生物信息库以及生物资源信息网络(联盟)相结合的运营模式,统筹计划、治理和利用遗传资源和生物信息。

       资源样本库用于贮存和治理珍贵的种种生物样本(来源于人,动、植物,微生物等),;の夜赜械囊糯试,为健康、农业、质料等生物工业产品研发项目提供全面专业的样本资源。

       生物信息库贮存和剖析重要物种全部相关数据(包括基因组学,转录组学,卵白组学,代谢组学等以及表型信息或临床信息数据),为国家重大战略计划中相关议题的研究论证与决策制定,提供科学的基础数据效劳。

       生物资源信息网络着力于整合海内乃至国际生物资源,搭建笼罩广泛的生物资源和生物信息网络联盟平台,增进信息和人才的交流、促成基于样本资源的的相助,增进样本资源的使用和开发,推动相关科研事情的开展和工业转化。

       大数据技术助力基因库建设

       2007年以来,随着第二代测序技术的兴起,生命科学已经从已往古板的实验性科学转向大数据科学。仅2010年的生物数据产出量是已往所有生物数据产出的10倍。测序技术飞速生长,使得人类基因组测序的本钱不绝下降,开展百万人的基因测序逐渐成为可能。按一个人30倍笼罩度盘算(约100GB的原始基因测序数据),加上种种剖析以及差别样本、时间点的数据,一个人的数据将抵达1TB。大数据时代的到来意味着数据存储、传输、剖析、应用的挑战,同时也意味着人类通过大数据进一步了解健康、生命数字化的时代向我们走来。

        张勇研究院透露,国家基因库已经与国家超等盘算天津中心、国家超等盘算深圳中心、国家超等盘算广州中心等机构展开战略性相助。目前基因库自身已拥有存储能力抵达40PB,总峰值盘算能力抵达每秒212万亿次,并拥有云存储技术,为海量生物资源表型数据及组学数据提供存储、处理和剖析支撑。

       依托雄厚的盘算机、网络硬件基础,国家基因库已经实现诸如:存储海量生物基因数据;提供生物信息检索、比较、剖析;提供生命科学研究平台,支撑种种基于数据的信息剖析流程的开发和运行等效劳,力求打造集科研、技术、工业、教育的生态系统。

       国家基因库目前拥有四十多个参考基因组数据库,包括近千种动物、植物、微生物基因组,占全球已完成大型基因组数量的80%以上,涵盖基因组、转录组、卵白质组、表观组等多组学数据以及表型数据和临床数据信息。其中人偏向的数据库包括:首个亚洲人基因组数据库、两千多种单基因遗传病数据库、中国肿瘤基因组(CCGC)数据库、海啸DNA数据库、人肠道菌群数据库等。

未来的生长和结果转化

       张勇研究院体现,到2015年,深圳国家基因库将建立国际一流的高效基因信息数据库,可溯源性生物样本资源库,完成3000万份可溯源性生物样本生存,实现对基因信息数据总量达1EB的会见支持。同时,围绕生物医学,生物农业和海洋生物等生物工业重点领域搭建基因信息资源挖掘的基础性支撑平台,全面提升我国生物工业的立异能力。

       国家基因库将为动植物育种、生态情况;ひ约傲俅布煅榭蒲А⒆窖А⒏鎏寤搅频裙ひ瞪ぬ峁┤嬷С。

       在新型农业方面,动植物分子育种、功效基因的掘客、新能源的开发利用等,需要基于大宗物种资源,搭建大型基因型和表型数据库,为育种者和开发者提供完整的信息指导,加速育种和开发的历程。

       通过收集和生存种种有价值的动植物种质资源,建立大规模的资源库或;で,;の镏值亩嘌,通过深入研究外界情况和生物之间的相互作用,对生态情况起到;ず图觳庾饔 国家基因库还将为数字健康治理、临床检测,疾病防治及生物制药等提供大宗样本数据的支撑,确保其针对性和准确率,便于验证技术的可靠性,并可利用大数据,在充分考虑人群差别的情况下,确定最佳战略。

       1月22日,来自华大基因研究院、国家基因库的张勇研究员将出席"2015(第二届)生物样本库与临床研究论坛"。届时,张勇研究员将详细介绍国家基因库的建设情况,并就如何在样本库之上搭建、运营大数据平台,以及由此带来的对临床研究和应用的推行动用进行详细的剖析和讨论。
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